Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms