Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGD1P98174 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGD1P98174 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FGD1P98174 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGD1P98174 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGD1P98174 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGD1P98174 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGD1P98174 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGD1P98174 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FGD1P98174 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGD1P98174 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGD1P98174 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGD1P98174 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGD1P98174 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGD1P98174 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGD1P98174 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGD1P98174 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGD1P98174 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGD1P98174 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGD1P98174 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGD1P98174 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGD1P98174 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGD1P98174 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
FGD1P98174 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGD1P98174 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGD1P98174 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGD1P98174 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGD1P98174 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGD1P98174 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGD1P98174 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGD1P98174 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGD1P98174 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
FGD1P98174 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGD1P98174 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGD1P98174 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGD1P98174 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGD1P98174 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGD1P98174 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
FGD1P98174 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGD1P98174 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGD1P98174 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGD1P98174 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
FGD1P98174 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGD1P98174 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGD1P98174 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGD1P98174 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGD1P98174 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGD1P98174 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGD1P98174 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGD1P98174 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGD1P98174 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGD1P98174 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGD1P98174 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGD1P98174 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGD1P98174 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGD1P98174 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGD1P98174 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FGD1P98174 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGD1P98174 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGD1P98174 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGD1P98174 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGD1P98174 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGD1P98174 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FGD1P98174 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FGD1P98174 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGD1P98174 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGD1P98174 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGD1P98174 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGD1P98174 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGD1P98174 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGD1P98174 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGD1P98174 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FGD1P98174 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FGD1P98174 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
FGD1P98174 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FGD1P98174 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FGD1P98174 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FGD1P98174 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FGD1P98174 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FGD1P98174 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FGD1P98174 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FGD1P98174 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FGD1P98174 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FGD1P98174 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
FGD1P98174 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FGD1P98174 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FGD1P98174 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FGD1P98174 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FGD1P98174 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FGD1P98174 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FGD1P98174 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FGD1P98174 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FGD1P98174 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FGD1P98174 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FGD1P98174 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FGD1P98174 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FGD1P98174 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
FGD1P98174 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FGD1P98174 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FGD1P98174 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms