Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRX1P78414 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRX1P78414 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRX1P78414 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRX1P78414 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRX1P78414 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRX1P78414 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRX1P78414 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRX1P78414 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRX1P78414 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRX1P78414 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRX1P78414 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRX1P78414 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRX1P78414 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
IRX1P78414 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRX1P78414 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRX1P78414 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRX1P78414 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRX1P78414 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
IRX1P78414 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRX1P78414 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
IRX1P78414 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRX1P78414 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRX1P78414 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRX1P78414 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
IRX1P78414 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRX1P78414 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRX1P78414 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRX1P78414 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRX1P78414 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRX1P78414 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRX1P78414 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRX1P78414 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRX1P78414 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRX1P78414 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRX1P78414 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRX1P78414 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRX1P78414 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRX1P78414 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRX1P78414 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRX1P78414 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRX1P78414 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRX1P78414 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRX1P78414 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRX1P78414 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRX1P78414 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRX1P78414 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRX1P78414 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRX1P78414 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRX1P78414 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRX1P78414 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRX1P78414 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRX1P78414 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRX1P78414 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRX1P78414 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRX1P78414 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRX1P78414 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRX1P78414 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRX1P78414 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRX1P78414 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRX1P78414 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRX1P78414 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRX1P78414 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
IRX1P78414 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRX1P78414 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRX1P78414 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRX1P78414 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRX1P78414 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRX1P78414 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRX1P78414 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRX1P78414 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRX1P78414 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRX1P78414 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRX1P78414 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRX1P78414 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRX1P78414 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRX1P78414 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRX1P78414 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRX1P78414 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRX1P78414 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRX1P78414 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRX1P78414 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRX1P78414 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRX1P78414 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRX1P78414 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRX1P78414 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRX1P78414 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRX1P78414 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
IRX1P78414 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRX1P78414 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRX1P78414 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRX1P78414 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRX1P78414 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRX1P78414 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRX1P78414 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRX1P78414 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRX1P78414 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRX1P78414 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRX1P78414 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRX1P78414 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms