Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GTF2IP78347 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GTF2IP78347 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GTF2IP78347 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GTF2IP78347 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2IP78347 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2IP78347 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2IP78347 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2IP78347 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2IP78347 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2IP78347 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2IP78347 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2IP78347 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2IP78347 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2IP78347 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2IP78347 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2IP78347 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2IP78347 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2IP78347 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2IP78347 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2IP78347 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2IP78347 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2IP78347 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2IP78347 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2IP78347 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2IP78347 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2IP78347 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2IP78347 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2IP78347 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2IP78347 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2IP78347 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2IP78347 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2IP78347 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2IP78347 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2IP78347 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2IP78347 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2IP78347 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2IP78347 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2IP78347 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GTF2IP78347 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2IP78347 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2IP78347 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2IP78347 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2IP78347 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2IP78347 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2IP78347 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2IP78347 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GTF2IP78347 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2IP78347 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2IP78347 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2IP78347 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2IP78347 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2IP78347 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2IP78347 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2IP78347 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2IP78347 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2IP78347 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2IP78347 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2IP78347 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2IP78347 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2IP78347 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2IP78347 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2IP78347 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2IP78347 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2IP78347 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2IP78347 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2IP78347 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2IP78347 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms