Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTBP60709 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTBP60709 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTBP60709 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTBP60709 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTBP60709 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTBP60709 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTBP60709 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTBP60709 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTBP60709 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTBP60709 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTBP60709 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTBP60709 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTBP60709 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTBP60709 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTBP60709 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTBP60709 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTBP60709 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTBP60709 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTBP60709 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTBP60709 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTBP60709 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTBP60709 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTBP60709 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTBP60709 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTBP60709 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTBP60709 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTBP60709 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTBP60709 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTBP60709 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTBP60709 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTBP60709 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTBP60709 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTBP60709 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTBP60709 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTBP60709 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTBP60709 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTBP60709 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTBP60709 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTBP60709 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTBP60709 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTBP60709 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTBP60709 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTBP60709 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTBP60709 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTBP60709 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTBP60709 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACTBP60709 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACTBP60709 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACTBP60709 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACTBP60709 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ACTBP60709 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACTBP60709 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACTBP60709 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACTBP60709 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACTBP60709 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTBP60709 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTBP60709 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTBP60709 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTBP60709 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTBP60709 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTBP60709 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTBP60709 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTBP60709 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTBP60709 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTBP60709 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTBP60709 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTBP60709 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTBP60709 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTBP60709 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTBP60709 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTBP60709 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTBP60709 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTBP60709 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTBP60709 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTBP60709 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTBP60709 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTBP60709 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTBP60709 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTBP60709 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTBP60709 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTBP60709 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTBP60709 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTBP60709 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTBP60709 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTBP60709 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTBP60709 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTBP60709 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTBP60709 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTBP60709 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTBP60709 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTBP60709 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTBP60709 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTBP60709 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTBP60709 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTBP60709 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTBP60709 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTBP60709 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTBP60709 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTBP60709 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms