Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms