Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms