Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTBP2P56545 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms