Protein–RNA interactions for Protein: P55087

AQP4, Aquaporin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AQP4P55087 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AQP4P55087 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AQP4P55087 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AQP4P55087 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AQP4P55087 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AQP4P55087 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AQP4P55087 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AQP4P55087 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AQP4P55087 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AQP4P55087 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AQP4P55087 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AQP4P55087 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AQP4P55087 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AQP4P55087 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AQP4P55087 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AQP4P55087 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AQP4P55087 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AQP4P55087 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AQP4P55087 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AQP4P55087 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AQP4P55087 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AQP4P55087 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AQP4P55087 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AQP4P55087 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AQP4P55087 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AQP4P55087 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AQP4P55087 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AQP4P55087 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AQP4P55087 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AQP4P55087 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AQP4P55087 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AQP4P55087 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AQP4P55087 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AQP4P55087 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AQP4P55087 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AQP4P55087 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AQP4P55087 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AQP4P55087 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AQP4P55087 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AQP4P55087 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AQP4P55087 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AQP4P55087 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AQP4P55087 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AQP4P55087 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AQP4P55087 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AQP4P55087 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
AQP4P55087 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
AQP4P55087 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AQP4P55087 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AQP4P55087 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AQP4P55087 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AQP4P55087 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AQP4P55087 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AQP4P55087 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AQP4P55087 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AQP4P55087 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AQP4P55087 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AQP4P55087 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AQP4P55087 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AQP4P55087 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AQP4P55087 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AQP4P55087 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AQP4P55087 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AQP4P55087 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AQP4P55087 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AQP4P55087 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AQP4P55087 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AQP4P55087 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AQP4P55087 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AQP4P55087 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AQP4P55087 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AQP4P55087 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AQP4P55087 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AQP4P55087 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AQP4P55087 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AQP4P55087 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AQP4P55087 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AQP4P55087 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AQP4P55087 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AQP4P55087 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AQP4P55087 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AQP4P55087 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AQP4P55087 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AQP4P55087 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
AQP4P55087 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AQP4P55087 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AQP4P55087 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
AQP4P55087 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AQP4P55087 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AQP4P55087 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AQP4P55087 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AQP4P55087 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AQP4P55087 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AQP4P55087 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AQP4P55087 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AQP4P55087 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AQP4P55087 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AQP4P55087 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AQP4P55087 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AQP4P55087 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms