Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BCAMP50895 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BCAMP50895 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BCAMP50895 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BCAMP50895 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BCAMP50895 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BCAMP50895 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BCAMP50895 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BCAMP50895 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BCAMP50895 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BCAMP50895 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BCAMP50895 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BCAMP50895 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BCAMP50895 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BCAMP50895 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BCAMP50895 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BCAMP50895 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BCAMP50895 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BCAMP50895 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BCAMP50895 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BCAMP50895 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BCAMP50895 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BCAMP50895 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BCAMP50895 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BCAMP50895 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BCAMP50895 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BCAMP50895 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BCAMP50895 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BCAMP50895 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BCAMP50895 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BCAMP50895 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BCAMP50895 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BCAMP50895 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BCAMP50895 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BCAMP50895 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BCAMP50895 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BCAMP50895 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BCAMP50895 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BCAMP50895 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BCAMP50895 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BCAMP50895 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BCAMP50895 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BCAMP50895 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BCAMP50895 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BCAMP50895 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BCAMP50895 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BCAMP50895 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BCAMP50895 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BCAMP50895 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BCAMP50895 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BCAMP50895 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BCAMP50895 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BCAMP50895 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BCAMP50895 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BCAMP50895 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCAMP50895 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCAMP50895 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCAMP50895 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCAMP50895 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCAMP50895 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCAMP50895 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCAMP50895 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCAMP50895 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCAMP50895 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCAMP50895 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BCAMP50895 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCAMP50895 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCAMP50895 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCAMP50895 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCAMP50895 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCAMP50895 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BCAMP50895 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BCAMP50895 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCAMP50895 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCAMP50895 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCAMP50895 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCAMP50895 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCAMP50895 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCAMP50895 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCAMP50895 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCAMP50895 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCAMP50895 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BCAMP50895 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCAMP50895 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCAMP50895 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCAMP50895 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCAMP50895 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCAMP50895 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCAMP50895 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCAMP50895 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BCAMP50895 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BCAMP50895 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BCAMP50895 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BCAMP50895 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BCAMP50895 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BCAMP50895 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BCAMP50895 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BCAMP50895 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BCAMP50895 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BCAMP50895 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms