Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
NUP153P49790 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUP153P49790 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUP153P49790 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUP153P49790 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUP153P49790 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUP153P49790 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUP153P49790 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUP153P49790 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
NUP153P49790 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUP153P49790 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUP153P49790 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUP153P49790 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUP153P49790 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUP153P49790 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUP153P49790 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUP153P49790 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUP153P49790 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUP153P49790 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUP153P49790 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
NUP153P49790 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUP153P49790 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
NUP153P49790 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
NUP153P49790 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
NUP153P49790 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUP153P49790 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUP153P49790 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUP153P49790 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUP153P49790 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUP153P49790 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUP153P49790 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUP153P49790 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUP153P49790 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUP153P49790 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUP153P49790 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NUP153P49790 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NUP153P49790 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NUP153P49790 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NUP153P49790 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NUP153P49790 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NUP153P49790 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NUP153P49790 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NUP153P49790 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NUP153P49790 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NUP153P49790 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NUP153P49790 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NUP153P49790 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NUP153P49790 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NUP153P49790 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NUP153P49790 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NUP153P49790 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NUP153P49790 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NUP153P49790 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NUP153P49790 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NUP153P49790 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NUP153P49790 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NUP153P49790 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
NUP153P49790 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
NUP153P49790 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NUP153P49790 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NUP153P49790 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NUP153P49790 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NUP153P49790 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NUP153P49790 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NUP153P49790 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NUP153P49790 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NUP153P49790 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NUP153P49790 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NUP153P49790 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NUP153P49790 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NUP153P49790 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NUP153P49790 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NUP153P49790 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NUP153P49790 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NUP153P49790 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NUP153P49790 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NUP153P49790 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NUP153P49790 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
NUP153P49790 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NUP153P49790 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NUP153P49790 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NUP153P49790 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NUP153P49790 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NUP153P49790 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NUP153P49790 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NUP153P49790 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NUP153P49790 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
NUP153P49790 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NUP153P49790 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NUP153P49790 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NUP153P49790 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NUP153P49790 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NUP153P49790 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NUP153P49790 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NUP153P49790 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NUP153P49790 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUP153P49790 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUP153P49790 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUP153P49790 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUP153P49790 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms