Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A3P48751 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A3P48751 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A3P48751 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A3P48751 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A3P48751 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A3P48751 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A3P48751 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A3P48751 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A3P48751 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A3P48751 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A3P48751 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A3P48751 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A3P48751 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A3P48751 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A3P48751 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A3P48751 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A3P48751 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A3P48751 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A3P48751 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A3P48751 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A3P48751 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A3P48751 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A3P48751 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A3P48751 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A3P48751 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A3P48751 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A3P48751 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A3P48751 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A3P48751 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A3P48751 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A3P48751 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A3P48751 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A3P48751 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A3P48751 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A3P48751 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A3P48751 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A3P48751 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A3P48751 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A3P48751 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A3P48751 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A3P48751 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A3P48751 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A3P48751 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A3P48751 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A3P48751 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A3P48751 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A3P48751 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A3P48751 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A3P48751 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A3P48751 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A3P48751 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A3P48751 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A3P48751 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A3P48751 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A3P48751 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A3P48751 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC4A3P48751 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC4A3P48751 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC4A3P48751 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC4A3P48751 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC4A3P48751 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A3P48751 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A3P48751 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A3P48751 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A3P48751 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A3P48751 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A3P48751 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A3P48751 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A3P48751 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A3P48751 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A3P48751 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A3P48751 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A3P48751 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A3P48751 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A3P48751 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A3P48751 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A3P48751 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A3P48751 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A3P48751 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A3P48751 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A3P48751 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A3P48751 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A3P48751 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A3P48751 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A3P48751 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A3P48751 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A3P48751 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A3P48751 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A3P48751 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A3P48751 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A3P48751 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A3P48751 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A3P48751 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A3P48751 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A3P48751 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A3P48751 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A3P48751 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A3P48751 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A3P48751 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms