Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
UTRNP46939 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UTRNP46939 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UTRNP46939 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UTRNP46939 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UTRNP46939 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UTRNP46939 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UTRNP46939 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UTRNP46939 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
UTRNP46939 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UTRNP46939 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UTRNP46939 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UTRNP46939 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UTRNP46939 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UTRNP46939 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UTRNP46939 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UTRNP46939 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UTRNP46939 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UTRNP46939 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UTRNP46939 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UTRNP46939 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UTRNP46939 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UTRNP46939 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UTRNP46939 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UTRNP46939 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UTRNP46939 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UTRNP46939 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UTRNP46939 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UTRNP46939 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UTRNP46939 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UTRNP46939 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
UTRNP46939 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UTRNP46939 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UTRNP46939 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UTRNP46939 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UTRNP46939 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UTRNP46939 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UTRNP46939 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UTRNP46939 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UTRNP46939 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UTRNP46939 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UTRNP46939 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UTRNP46939 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UTRNP46939 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UTRNP46939 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UTRNP46939 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UTRNP46939 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UTRNP46939 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UTRNP46939 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UTRNP46939 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UTRNP46939 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UTRNP46939 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UTRNP46939 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UTRNP46939 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UTRNP46939 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UTRNP46939 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UTRNP46939 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UTRNP46939 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UTRNP46939 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UTRNP46939 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UTRNP46939 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
UTRNP46939 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UTRNP46939 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UTRNP46939 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
UTRNP46939 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UTRNP46939 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
UTRNP46939 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UTRNP46939 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UTRNP46939 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UTRNP46939 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UTRNP46939 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UTRNP46939 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UTRNP46939 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UTRNP46939 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UTRNP46939 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UTRNP46939 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UTRNP46939 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UTRNP46939 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UTRNP46939 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
UTRNP46939 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UTRNP46939 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UTRNP46939 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UTRNP46939 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UTRNP46939 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UTRNP46939 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
UTRNP46939 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UTRNP46939 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UTRNP46939 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UTRNP46939 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UTRNP46939 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UTRNP46939 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UTRNP46939 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UTRNP46939 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UTRNP46939 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UTRNP46939 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UTRNP46939 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UTRNP46939 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UTRNP46939 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UTRNP46939 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UTRNP46939 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms