Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MCAMP43121 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCAMP43121 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCAMP43121 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCAMP43121 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCAMP43121 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MCAMP43121 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MCAMP43121 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCAMP43121 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MCAMP43121 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCAMP43121 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCAMP43121 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCAMP43121 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCAMP43121 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCAMP43121 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCAMP43121 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCAMP43121 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCAMP43121 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCAMP43121 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MCAMP43121 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MCAMP43121 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCAMP43121 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCAMP43121 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCAMP43121 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCAMP43121 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCAMP43121 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCAMP43121 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCAMP43121 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCAMP43121 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MCAMP43121 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCAMP43121 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MCAMP43121 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MCAMP43121 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MCAMP43121 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MCAMP43121 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MCAMP43121 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MCAMP43121 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MCAMP43121 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MCAMP43121 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCAMP43121 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCAMP43121 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCAMP43121 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCAMP43121 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCAMP43121 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCAMP43121 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCAMP43121 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCAMP43121 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MCAMP43121 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCAMP43121 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCAMP43121 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCAMP43121 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCAMP43121 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCAMP43121 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCAMP43121 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCAMP43121 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCAMP43121 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCAMP43121 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCAMP43121 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCAMP43121 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCAMP43121 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCAMP43121 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCAMP43121 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCAMP43121 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCAMP43121 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCAMP43121 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCAMP43121 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCAMP43121 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCAMP43121 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCAMP43121 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCAMP43121 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCAMP43121 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCAMP43121 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCAMP43121 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCAMP43121 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCAMP43121 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCAMP43121 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCAMP43121 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCAMP43121 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCAMP43121 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCAMP43121 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCAMP43121 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCAMP43121 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCAMP43121 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCAMP43121 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCAMP43121 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MCAMP43121 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCAMP43121 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCAMP43121 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCAMP43121 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCAMP43121 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCAMP43121 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCAMP43121 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCAMP43121 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MCAMP43121 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCAMP43121 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCAMP43121 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCAMP43121 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCAMP43121 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCAMP43121 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCAMP43121 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms