Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM23P36406 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM23P36406 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms