Protein–RNA interactions for Protein: P35916

FLT4, Vascular endothelial growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT4P35916 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FLT4P35916 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FLT4P35916 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FLT4P35916 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FLT4P35916 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FLT4P35916 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FLT4P35916 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FLT4P35916 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FLT4P35916 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FLT4P35916 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FLT4P35916 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FLT4P35916 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FLT4P35916 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FLT4P35916 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FLT4P35916 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FLT4P35916 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FLT4P35916 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FLT4P35916 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FLT4P35916 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FLT4P35916 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FLT4P35916 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FLT4P35916 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FLT4P35916 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FLT4P35916 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FLT4P35916 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FLT4P35916 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FLT4P35916 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FLT4P35916 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FLT4P35916 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FLT4P35916 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FLT4P35916 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FLT4P35916 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FLT4P35916 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FLT4P35916 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FLT4P35916 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FLT4P35916 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FLT4P35916 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FLT4P35916 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FLT4P35916 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FLT4P35916 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FLT4P35916 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FLT4P35916 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FLT4P35916 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FLT4P35916 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FLT4P35916 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FLT4P35916 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FLT4P35916 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FLT4P35916 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FLT4P35916 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FLT4P35916 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FLT4P35916 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FLT4P35916 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FLT4P35916 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FLT4P35916 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FLT4P35916 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FLT4P35916 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FLT4P35916 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FLT4P35916 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FLT4P35916 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FLT4P35916 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FLT4P35916 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FLT4P35916 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FLT4P35916 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FLT4P35916 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FLT4P35916 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FLT4P35916 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FLT4P35916 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FLT4P35916 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FLT4P35916 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FLT4P35916 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FLT4P35916 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FLT4P35916 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FLT4P35916 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FLT4P35916 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FLT4P35916 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FLT4P35916 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FLT4P35916 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FLT4P35916 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FLT4P35916 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FLT4P35916 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FLT4P35916 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FLT4P35916 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FLT4P35916 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FLT4P35916 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FLT4P35916 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FLT4P35916 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FLT4P35916 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FLT4P35916 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FLT4P35916 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FLT4P35916 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FLT4P35916 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
FLT4P35916 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FLT4P35916 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FLT4P35916 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FLT4P35916 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FLT4P35916 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FLT4P35916 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FLT4P35916 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FLT4P35916 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FLT4P35916 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms