Protein–RNA interactions for Protein: P35670

ATP7B, Copper-transporting ATPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7BP35670 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP7BP35670 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP7BP35670 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP7BP35670 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP7BP35670 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP7BP35670 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP7BP35670 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP7BP35670 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP7BP35670 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP7BP35670 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP7BP35670 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP7BP35670 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP7BP35670 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP7BP35670 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP7BP35670 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP7BP35670 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP7BP35670 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP7BP35670 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP7BP35670 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP7BP35670 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP7BP35670 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP7BP35670 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP7BP35670 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP7BP35670 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP7BP35670 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP7BP35670 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP7BP35670 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP7BP35670 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP7BP35670 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP7BP35670 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP7BP35670 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP7BP35670 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP7BP35670 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP7BP35670 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP7BP35670 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP7BP35670 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP7BP35670 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP7BP35670 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP7BP35670 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP7BP35670 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP7BP35670 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP7BP35670 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP7BP35670 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP7BP35670 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP7BP35670 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP7BP35670 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP7BP35670 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP7BP35670 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP7BP35670 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP7BP35670 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP7BP35670 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP7BP35670 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP7BP35670 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP7BP35670 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP7BP35670 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP7BP35670 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP7BP35670 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP7BP35670 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP7BP35670 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP7BP35670 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP7BP35670 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP7BP35670 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP7BP35670 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP7BP35670 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP7BP35670 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP7BP35670 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP7BP35670 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP7BP35670 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP7BP35670 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP7BP35670 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP7BP35670 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP7BP35670 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP7BP35670 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP7BP35670 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP7BP35670 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP7BP35670 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP7BP35670 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP7BP35670 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP7BP35670 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP7BP35670 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP7BP35670 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP7BP35670 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP7BP35670 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP7BP35670 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP7BP35670 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP7BP35670 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP7BP35670 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP7BP35670 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP7BP35670 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP7BP35670 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP7BP35670 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP7BP35670 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP7BP35670 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP7BP35670 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP7BP35670 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP7BP35670 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP7BP35670 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP7BP35670 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP7BP35670 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP7BP35670 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms