Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTN2P35609 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTN2P35609 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTN2P35609 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTN2P35609 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTN2P35609 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTN2P35609 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTN2P35609 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTN2P35609 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTN2P35609 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTN2P35609 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTN2P35609 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTN2P35609 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTN2P35609 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTN2P35609 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTN2P35609 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTN2P35609 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTN2P35609 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTN2P35609 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTN2P35609 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTN2P35609 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTN2P35609 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTN2P35609 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTN2P35609 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTN2P35609 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTN2P35609 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTN2P35609 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTN2P35609 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTN2P35609 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTN2P35609 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTN2P35609 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTN2P35609 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTN2P35609 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTN2P35609 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTN2P35609 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTN2P35609 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTN2P35609 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTN2P35609 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTN2P35609 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTN2P35609 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTN2P35609 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTN2P35609 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTN2P35609 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTN2P35609 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTN2P35609 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTN2P35609 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTN2P35609 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTN2P35609 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTN2P35609 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTN2P35609 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTN2P35609 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTN2P35609 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTN2P35609 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTN2P35609 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTN2P35609 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTN2P35609 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTN2P35609 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTN2P35609 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTN2P35609 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTN2P35609 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTN2P35609 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTN2P35609 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ACTN2P35609 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ACTN2P35609 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ACTN2P35609 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ACTN2P35609 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ACTN2P35609 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ACTN2P35609 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ACTN2P35609 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ACTN2P35609 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ACTN2P35609 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ACTN2P35609 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms