Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCKBRP32239 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms