Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA7P31268 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms