Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ATP5DP30049 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
ATP5DP30049 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ATP5DP30049 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ATP5DP30049 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP5DP30049 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms