Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KDM5AP29375 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
KDM5AP29375 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms