Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCAP28676 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCAP28676 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCAP28676 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCAP28676 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GCAP28676 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCAP28676 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCAP28676 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCAP28676 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCAP28676 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCAP28676 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCAP28676 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCAP28676 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCAP28676 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCAP28676 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCAP28676 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GCAP28676 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GCAP28676 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GCAP28676 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GCAP28676 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GCAP28676 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GCAP28676 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GCAP28676 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GCAP28676 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GCAP28676 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GCAP28676 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GCAP28676 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GCAP28676 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GCAP28676 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GCAP28676 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GCAP28676 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GCAP28676 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GCAP28676 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GCAP28676 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GCAP28676 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GCAP28676 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GCAP28676 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GCAP28676 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GCAP28676 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GCAP28676 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GCAP28676 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GCAP28676 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GCAP28676 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GCAP28676 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GCAP28676 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GCAP28676 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GCAP28676 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GCAP28676 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GCAP28676 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GCAP28676 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GCAP28676 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GCAP28676 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GCAP28676 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GCAP28676 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GCAP28676 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GCAP28676 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GCAP28676 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GCAP28676 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GCAP28676 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GCAP28676 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GCAP28676 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GCAP28676 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GCAP28676 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GCAP28676 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GCAP28676 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GCAP28676 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GCAP28676 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GCAP28676 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GCAP28676 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GCAP28676 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GCAP28676 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GCAP28676 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GCAP28676 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GCAP28676 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GCAP28676 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GCAP28676 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GCAP28676 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GCAP28676 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GCAP28676 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GCAP28676 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GCAP28676 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GCAP28676 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GCAP28676 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GCAP28676 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GCAP28676 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GCAP28676 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GCAP28676 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GCAP28676 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GCAP28676 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GCAP28676 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GCAP28676 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GCAP28676 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GCAP28676 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GCAP28676 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GCAP28676 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GCAP28676 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GCAP28676 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GCAP28676 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GCAP28676 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GCAP28676 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms