Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms