Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
IL3RAP26951 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms