Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms