Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRBP23467 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
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