Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGS1P23219 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGS1P23219 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGS1P23219 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGS1P23219 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGS1P23219 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGS1P23219 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGS1P23219 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGS1P23219 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGS1P23219 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGS1P23219 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGS1P23219 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGS1P23219 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGS1P23219 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGS1P23219 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGS1P23219 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGS1P23219 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGS1P23219 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGS1P23219 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGS1P23219 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGS1P23219 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGS1P23219 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGS1P23219 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGS1P23219 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGS1P23219 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGS1P23219 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGS1P23219 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGS1P23219 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGS1P23219 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGS1P23219 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGS1P23219 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGS1P23219 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGS1P23219 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGS1P23219 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGS1P23219 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGS1P23219 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGS1P23219 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGS1P23219 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGS1P23219 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGS1P23219 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGS1P23219 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGS1P23219 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGS1P23219 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGS1P23219 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGS1P23219 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGS1P23219 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGS1P23219 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGS1P23219 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGS1P23219 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGS1P23219 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGS1P23219 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGS1P23219 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGS1P23219 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGS1P23219 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGS1P23219 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGS1P23219 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGS1P23219 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGS1P23219 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGS1P23219 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGS1P23219 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGS1P23219 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGS1P23219 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGS1P23219 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGS1P23219 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGS1P23219 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGS1P23219 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGS1P23219 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGS1P23219 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGS1P23219 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms