Protein–RNA interactions for Protein: P21757

MSR1, Macrophage scavenger receptor types I and II, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSR1P21757 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MSR1P21757 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MSR1P21757 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MSR1P21757 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MSR1P21757 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MSR1P21757 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MSR1P21757 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MSR1P21757 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MSR1P21757 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MSR1P21757 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MSR1P21757 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MSR1P21757 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MSR1P21757 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MSR1P21757 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSR1P21757 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MSR1P21757 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSR1P21757 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSR1P21757 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSR1P21757 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSR1P21757 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSR1P21757 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSR1P21757 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSR1P21757 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSR1P21757 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSR1P21757 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSR1P21757 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSR1P21757 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSR1P21757 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSR1P21757 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSR1P21757 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSR1P21757 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSR1P21757 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSR1P21757 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSR1P21757 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSR1P21757 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSR1P21757 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSR1P21757 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSR1P21757 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSR1P21757 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSR1P21757 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSR1P21757 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSR1P21757 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSR1P21757 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSR1P21757 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSR1P21757 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSR1P21757 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSR1P21757 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSR1P21757 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSR1P21757 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSR1P21757 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSR1P21757 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSR1P21757 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSR1P21757 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSR1P21757 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSR1P21757 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSR1P21757 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSR1P21757 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSR1P21757 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSR1P21757 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSR1P21757 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSR1P21757 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSR1P21757 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSR1P21757 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSR1P21757 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSR1P21757 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSR1P21757 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MSR1P21757 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MSR1P21757 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MSR1P21757 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MSR1P21757 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MSR1P21757 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MSR1P21757 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MSR1P21757 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MSR1P21757 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MSR1P21757 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MSR1P21757 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MSR1P21757 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MSR1P21757 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MSR1P21757 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MSR1P21757 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MSR1P21757 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MSR1P21757 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MSR1P21757 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MSR1P21757 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MSR1P21757 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MSR1P21757 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MSR1P21757 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MSR1P21757 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MSR1P21757 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MSR1P21757 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MSR1P21757 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MSR1P21757 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MSR1P21757 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
MSR1P21757 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
MSR1P21757 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MSR1P21757 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
MSR1P21757 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MSR1P21757 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
MSR1P21757 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MSR1P21757 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms