Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms