Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMY2BP19961 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms