Protein–RNA interactions for Protein: P18754

RCC1, Regulator of chromosome condensation, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC1P18754 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RCC1P18754 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RCC1P18754 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RCC1P18754 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RCC1P18754 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RCC1P18754 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RCC1P18754 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RCC1P18754 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RCC1P18754 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RCC1P18754 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RCC1P18754 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RCC1P18754 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RCC1P18754 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RCC1P18754 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RCC1P18754 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RCC1P18754 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RCC1P18754 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RCC1P18754 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RCC1P18754 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RCC1P18754 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RCC1P18754 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RCC1P18754 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RCC1P18754 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RCC1P18754 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RCC1P18754 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RCC1P18754 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RCC1P18754 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RCC1P18754 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RCC1P18754 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RCC1P18754 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RCC1P18754 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RCC1P18754 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RCC1P18754 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RCC1P18754 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RCC1P18754 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RCC1P18754 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RCC1P18754 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RCC1P18754 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RCC1P18754 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RCC1P18754 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RCC1P18754 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RCC1P18754 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RCC1P18754 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RCC1P18754 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RCC1P18754 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RCC1P18754 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RCC1P18754 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RCC1P18754 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RCC1P18754 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RCC1P18754 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RCC1P18754 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RCC1P18754 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RCC1P18754 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RCC1P18754 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RCC1P18754 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RCC1P18754 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RCC1P18754 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RCC1P18754 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RCC1P18754 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RCC1P18754 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RCC1P18754 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RCC1P18754 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RCC1P18754 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RCC1P18754 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RCC1P18754 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RCC1P18754 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RCC1P18754 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RCC1P18754 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RCC1P18754 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RCC1P18754 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RCC1P18754 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RCC1P18754 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RCC1P18754 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RCC1P18754 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RCC1P18754 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RCC1P18754 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RCC1P18754 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RCC1P18754 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
RCC1P18754 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RCC1P18754 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RCC1P18754 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RCC1P18754 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RCC1P18754 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RCC1P18754 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RCC1P18754 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RCC1P18754 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RCC1P18754 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RCC1P18754 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RCC1P18754 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RCC1P18754 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RCC1P18754 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RCC1P18754 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RCC1P18754 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RCC1P18754 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RCC1P18754 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RCC1P18754 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RCC1P18754 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RCC1P18754 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RCC1P18754 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RCC1P18754 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms