Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DESP17661 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DESP17661 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DESP17661 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DESP17661 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DESP17661 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DESP17661 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DESP17661 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DESP17661 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DESP17661 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DESP17661 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DESP17661 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DESP17661 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DESP17661 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DESP17661 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DESP17661 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DESP17661 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DESP17661 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DESP17661 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DESP17661 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DESP17661 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DESP17661 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DESP17661 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DESP17661 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DESP17661 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DESP17661 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DESP17661 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DESP17661 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DESP17661 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DESP17661 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DESP17661 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
DESP17661 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DESP17661 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DESP17661 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DESP17661 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DESP17661 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
DESP17661 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DESP17661 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DESP17661 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DESP17661 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DESP17661 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DESP17661 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DESP17661 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DESP17661 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DESP17661 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DESP17661 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
DESP17661 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DESP17661 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DESP17661 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DESP17661 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DESP17661 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DESP17661 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DESP17661 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DESP17661 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DESP17661 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
DESP17661 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
DESP17661 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DESP17661 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DESP17661 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DESP17661 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DESP17661 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DESP17661 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DESP17661 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DESP17661 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DESP17661 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DESP17661 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DESP17661 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DESP17661 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DESP17661 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DESP17661 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
DESP17661 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DESP17661 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DESP17661 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DESP17661 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DESP17661 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DESP17661 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DESP17661 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DESP17661 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DESP17661 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DESP17661 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DESP17661 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DESP17661 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DESP17661 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DESP17661 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DESP17661 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DESP17661 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DESP17661 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DESP17661 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DESP17661 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DESP17661 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DESP17661 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DESP17661 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DESP17661 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DESP17661 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DESP17661 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DESP17661 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DESP17661 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DESP17661 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DESP17661 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
DESP17661 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms