Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ITGB4P16144 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms