Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME1P15531 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NME1P15531 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NME1P15531 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NME1P15531 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NME1P15531 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NME1P15531 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NME1P15531 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NME1P15531 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NME1P15531 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NME1P15531 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NME1P15531 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NME1P15531 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NME1P15531 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NME1P15531 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NME1P15531 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NME1P15531 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NME1P15531 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NME1P15531 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NME1P15531 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NME1P15531 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NME1P15531 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NME1P15531 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NME1P15531 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NME1P15531 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NME1P15531 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NME1P15531 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NME1P15531 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NME1P15531 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NME1P15531 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NME1P15531 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NME1P15531 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NME1P15531 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NME1P15531 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NME1P15531 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NME1P15531 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NME1P15531 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NME1P15531 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NME1P15531 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NME1P15531 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NME1P15531 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NME1P15531 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NME1P15531 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NME1P15531 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NME1P15531 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NME1P15531 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NME1P15531 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NME1P15531 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NME1P15531 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NME1P15531 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NME1P15531 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NME1P15531 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NME1P15531 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NME1P15531 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME1P15531 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME1P15531 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME1P15531 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME1P15531 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME1P15531 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME1P15531 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME1P15531 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME1P15531 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME1P15531 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME1P15531 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME1P15531 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME1P15531 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME1P15531 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NME1P15531 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME1P15531 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NME1P15531 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NME1P15531 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NME1P15531 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME1P15531 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NME1P15531 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME1P15531 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME1P15531 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME1P15531 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME1P15531 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME1P15531 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME1P15531 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME1P15531 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME1P15531 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME1P15531 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NME1P15531 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NME1P15531 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NME1P15531 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NME1P15531 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NME1P15531 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NME1P15531 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NME1P15531 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NME1P15531 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NME1P15531 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NME1P15531 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NME1P15531 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NME1P15531 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NME1P15531 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NME1P15531 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NME1P15531 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NME1P15531 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NME1P15531 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms