Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXB3P14651 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms