Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms