Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL6A2P12110 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL6A2P12110 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL6A2P12110 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
COL6A2P12110 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
COL6A2P12110 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
COL6A2P12110 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL6A2P12110 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms