Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms