Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HKR1P10072 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HKR1P10072 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HKR1P10072 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HKR1P10072 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HKR1P10072 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HKR1P10072 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HKR1P10072 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HKR1P10072 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HKR1P10072 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HKR1P10072 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HKR1P10072 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HKR1P10072 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HKR1P10072 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HKR1P10072 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HKR1P10072 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HKR1P10072 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HKR1P10072 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HKR1P10072 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HKR1P10072 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HKR1P10072 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HKR1P10072 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HKR1P10072 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HKR1P10072 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HKR1P10072 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HKR1P10072 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HKR1P10072 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HKR1P10072 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HKR1P10072 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HKR1P10072 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HKR1P10072 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HKR1P10072 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HKR1P10072 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HKR1P10072 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HKR1P10072 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HKR1P10072 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HKR1P10072 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HKR1P10072 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HKR1P10072 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HKR1P10072 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HKR1P10072 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HKR1P10072 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HKR1P10072 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HKR1P10072 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HKR1P10072 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HKR1P10072 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HKR1P10072 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HKR1P10072 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HKR1P10072 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HKR1P10072 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HKR1P10072 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HKR1P10072 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HKR1P10072 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HKR1P10072 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HKR1P10072 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HKR1P10072 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HKR1P10072 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HKR1P10072 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HKR1P10072 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HKR1P10072 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HKR1P10072 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HKR1P10072 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HKR1P10072 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HKR1P10072 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HKR1P10072 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HKR1P10072 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HKR1P10072 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HKR1P10072 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HKR1P10072 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HKR1P10072 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HKR1P10072 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HKR1P10072 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HKR1P10072 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HKR1P10072 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HKR1P10072 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HKR1P10072 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HKR1P10072 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HKR1P10072 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HKR1P10072 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HKR1P10072 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HKR1P10072 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HKR1P10072 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HKR1P10072 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HKR1P10072 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HKR1P10072 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HKR1P10072 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HKR1P10072 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HKR1P10072 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HKR1P10072 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HKR1P10072 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HKR1P10072 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HKR1P10072 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HKR1P10072 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HKR1P10072 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HKR1P10072 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HKR1P10072 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HKR1P10072 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HKR1P10072 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HKR1P10072 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HKR1P10072 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms