Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.95■■□□□ 1.27
C4AP0C0L4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms