Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEFMP07197 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEFMP07197 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NEFMP07197 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEFMP07197 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEFMP07197 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NEFMP07197 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEFMP07197 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEFMP07197 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEFMP07197 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NEFMP07197 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.51
NEFMP07197 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEFMP07197 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEFMP07197 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEFMP07197 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEFMP07197 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEFMP07197 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEFMP07197 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEFMP07197 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEFMP07197 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEFMP07197 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEFMP07197 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NEFMP07197 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEFMP07197 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEFMP07197 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEFMP07197 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEFMP07197 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEFMP07197 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEFMP07197 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEFMP07197 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NEFMP07197 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEFMP07197 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NEFMP07197 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEFMP07197 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEFMP07197 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEFMP07197 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEFMP07197 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEFMP07197 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEFMP07197 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEFMP07197 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEFMP07197 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEFMP07197 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NEFMP07197 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEFMP07197 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEFMP07197 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEFMP07197 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEFMP07197 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEFMP07197 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEFMP07197 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEFMP07197 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEFMP07197 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEFMP07197 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEFMP07197 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEFMP07197 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEFMP07197 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEFMP07197 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEFMP07197 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NEFMP07197 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEFMP07197 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEFMP07197 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEFMP07197 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEFMP07197 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEFMP07197 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEFMP07197 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEFMP07197 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEFMP07197 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEFMP07197 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEFMP07197 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEFMP07197 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEFMP07197 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEFMP07197 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEFMP07197 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEFMP07197 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEFMP07197 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEFMP07197 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEFMP07197 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEFMP07197 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEFMP07197 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEFMP07197 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEFMP07197 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEFMP07197 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEFMP07197 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEFMP07197 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEFMP07197 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEFMP07197 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEFMP07197 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEFMP07197 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEFMP07197 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEFMP07197 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEFMP07197 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEFMP07197 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEFMP07197 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEFMP07197 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEFMP07197 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEFMP07197 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEFMP07197 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEFMP07197 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEFMP07197 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEFMP07197 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEFMP07197 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms