Protein–RNA interactions for Protein: O95613

PCNT, Pericentrin, humanhuman

Predictions only

Length 3,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNTO95613 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCNTO95613 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCNTO95613 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PCNTO95613 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCNTO95613 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PCNTO95613 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PCNTO95613 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCNTO95613 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PCNTO95613 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCNTO95613 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCNTO95613 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PCNTO95613 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PCNTO95613 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
PCNTO95613 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PCNTO95613 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCNTO95613 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PCNTO95613 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCNTO95613 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCNTO95613 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCNTO95613 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCNTO95613 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCNTO95613 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PCNTO95613 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PCNTO95613 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PCNTO95613 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCNTO95613 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PCNTO95613 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCNTO95613 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PCNTO95613 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PCNTO95613 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCNTO95613 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PCNTO95613 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCNTO95613 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PCNTO95613 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCNTO95613 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PCNTO95613 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PCNTO95613 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PCNTO95613 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCNTO95613 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCNTO95613 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCNTO95613 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PCNTO95613 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PCNTO95613 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCNTO95613 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCNTO95613 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCNTO95613 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCNTO95613 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCNTO95613 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PCNTO95613 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCNTO95613 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCNTO95613 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PCNTO95613 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PCNTO95613 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PCNTO95613 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PCNTO95613 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCNTO95613 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCNTO95613 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PCNTO95613 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
PCNTO95613 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PCNTO95613 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCNTO95613 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PCNTO95613 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCNTO95613 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PCNTO95613 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PCNTO95613 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCNTO95613 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCNTO95613 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCNTO95613 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PCNTO95613 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PCNTO95613 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PCNTO95613 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCNTO95613 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PCNTO95613 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PCNTO95613 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCNTO95613 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PCNTO95613 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PCNTO95613 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCNTO95613 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PCNTO95613 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCNTO95613 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCNTO95613 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PCNTO95613 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCNTO95613 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PCNTO95613 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PCNTO95613 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PCNTO95613 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCNTO95613 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCNTO95613 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCNTO95613 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCNTO95613 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCNTO95613 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PCNTO95613 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCNTO95613 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCNTO95613 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCNTO95613 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PCNTO95613 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCNTO95613 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PCNTO95613 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PCNTO95613 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PCNTO95613 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms