Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBOX1O75936 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms