Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms