Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms