Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNSO60931 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNSO60931 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNSO60931 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNSO60931 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNSO60931 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNSO60931 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNSO60931 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNSO60931 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNSO60931 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNSO60931 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNSO60931 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNSO60931 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNSO60931 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNSO60931 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNSO60931 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNSO60931 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNSO60931 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNSO60931 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNSO60931 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNSO60931 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNSO60931 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNSO60931 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNSO60931 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNSO60931 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNSO60931 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNSO60931 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNSO60931 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNSO60931 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNSO60931 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNSO60931 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNSO60931 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNSO60931 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNSO60931 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNSO60931 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNSO60931 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNSO60931 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNSO60931 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNSO60931 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNSO60931 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNSO60931 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNSO60931 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNSO60931 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNSO60931 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNSO60931 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNSO60931 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNSO60931 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNSO60931 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNSO60931 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNSO60931 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNSO60931 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNSO60931 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNSO60931 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNSO60931 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNSO60931 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNSO60931 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNSO60931 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNSO60931 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNSO60931 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNSO60931 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNSO60931 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNSO60931 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNSO60931 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNSO60931 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNSO60931 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNSO60931 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNSO60931 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNSO60931 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNSO60931 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNSO60931 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNSO60931 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNSO60931 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNSO60931 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNSO60931 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNSO60931 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNSO60931 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNSO60931 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNSO60931 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNSO60931 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNSO60931 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNSO60931 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNSO60931 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNSO60931 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNSO60931 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNSO60931 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNSO60931 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNSO60931 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNSO60931 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNSO60931 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNSO60931 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNSO60931 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNSO60931 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNSO60931 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNSO60931 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNSO60931 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNSO60931 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNSO60931 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNSO60931 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNSO60931 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNSO60931 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms