Protein–RNA interactions for Protein: O60841

EIF5B, Eukaryotic translation initiation factor 5B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF5BO60841 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF5BO60841 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF5BO60841 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF5BO60841 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF5BO60841 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF5BO60841 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF5BO60841 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF5BO60841 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF5BO60841 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF5BO60841 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF5BO60841 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF5BO60841 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF5BO60841 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF5BO60841 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF5BO60841 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF5BO60841 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF5BO60841 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF5BO60841 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF5BO60841 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF5BO60841 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF5BO60841 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF5BO60841 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF5BO60841 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF5BO60841 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF5BO60841 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF5BO60841 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF5BO60841 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF5BO60841 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF5BO60841 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF5BO60841 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF5BO60841 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF5BO60841 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF5BO60841 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
EIF5BO60841 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
EIF5BO60841 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms