Protein–RNA interactions for Protein: O60830

TIMM17B, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17-B, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17BO60830 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC12.27□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
TIMM17BO60830 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms