Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KIAA0556O60303 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms